Träger der Schule Marienau ist ein gemeinnütziger Verein (e.V.) und dient unmittelbar und ausschließlich der Förderung der Erziehung und Bildung. Zur Verwirklichung dieses Zweckes dient die Schule Marienau, wo Mädchen und Jungen nach den Zielen der Reformpädagogik erzogen und in der staatlich anerkannten Internatsschule in freier Trägerschaft unterrichtet werden. Der im Vereinsregister in Lüneburg eingetragene rechtsfähige Verein wird durch den Vorstand vertreten. Entsprechend der bestehenden Geschäftsordnung werden die laufenden Geschäfte des Vereins durch Schulleitung und Geschäftsführung geführt.